علائم کمبود فسفر در گیاهان می تواند در بین گونه های مختلف متفاوت باشد اما شباهت هایی وجود دارد که چگونه کمبود مواد مغذی ، رنگ و ظاهر بافت گیاه را تحت تاثیر قرار می دهد. کمبود مواد غذایی به طور معمول با محل فیزیکی گیاه ارتباط دارد (به عنوان مثال، آیا علائم در ابتدا در بافت سالم و تازه شکل گرفته مشاهده می شود یا در بافت قدیمی)، اما این علائم می تواند با افزایش شدت کمبود گسترش یابد.
علایم کمبود فسفر در گیاهان شبیه به کمبود ازت می باشد. در اثر کمبود فسفر در گیاه رشد بخش هوایی و ریشه هر دو کند و یا متوقف میشود. برگها کوتاه، باریک و نازک میشوند و در این حالت دمبرگها زاویه کوچکی را با شاخه تشکیل میدهند. رشد طولی گیاه عمودی بوده و شاخههای جانبی کمتر رشد مییابند. تعداد برگها کاهش یافته و جوانهها میمیرند و تعداد شکوفهها کاهش مییابد بنابراین از محصول میوه نیز کاسته میشود. برگها به رنگ سبز تیره مایل به آبی یا ارغوانی در میآیند و گاهی لکهها و یا نوارهایی به همین رنگ بر روی پهنک برگ ظاهر میشود. رنگ ارغوانی که مربوط به ماده آنتوسیانین میباشد از مشخص ترین علائم کمبود فسفر در درختان میوه میباشد. کمبود فسفر فعل و انفعالات سوخت و ساز نظیر تبدیل قند به نشاسته را متوقف میسازد و در نهایت آنتوسیانین در برگ تشکیل میشود. علائم کمبود در برگهای پیر مشاهده میشود و برگهای جوان سرشاخهها به رنگ سبز طبیعی باقی میمانند. در هنگام کمبود فسفر در بعضی از میوه ها، گوشت میوه نرم و شیره میوه خیلی ترش و خاصیت انباری آن کاهش مییابد.